1911年11月24日邢其毅出生在天津，祖籍贵阳，其父为清末翰林。1933年，邢老获得辅仁大学化学系学士学位后赴美进入 University of Illinois 从事研究工作。1936年，邢老获得University of Illinois博士学位后进入LMU München攻读博士后，期间进行了蟾蜍毒素（toad poison）的研究和芦竹碱（Arundo donax L.）的结构与合成。

1937年，邢老放弃国外优厚的生活待遇毅然回国加入抗日战争。1944年，他不顾生命危险从敌后来到解放区加入新四军，为我国培养医药人才和制备药品。解放后，邢老受聘兼任辅仁大学（原北京辅仁大学）化学系负责人，1951年他开展了蝎毒素中多肽成分和氨基酸、多肽等方面的研究，1980年当选中科院院士。

早在美国留学期间，邢老即完成了联苯立体化学的博士论文，在德国期间完成的芦竹碱合成与结构测定在有机化学合成领域得到广泛应用。因国内抗疟需要，邢老研究金鸡纳的提取发表了云南河口地区金鸡纳树皮成分分析的报告，为国内抗疟提供了指导。

1959年，国家决定在人工合成胰岛素方面进行突破，邢老作为学术专家参与其中，经过无数日夜的奋斗，1965年终于完成了世界首个人工合成的结晶牛胰岛素的工作精准一肖一码。这是人类首次人工合成有活性的蛋白质。邢老还对中药的有效成分进行研究，多次开展中药水煎剂（水溶成分）的研究。他分解出人参的有效成分，并对这些成分的活性和结构进行研究，为中药的提纯工作作出贡献。

数十年的教学生涯中，邢老注重对学生能力的培养，强调学以致用，将实验课和实验技能相结合，为国家培养了一大批优秀人才。他讲课幽默风趣、思维开阔却又概念准确，在广大师生中留下深刻印象。

2002年11月4日，邢老在京去世，享年91岁。